هدف العمل فى قطاع البحوث الزراعية الى النهوض بالمحاصيل السكرية مما يؤدى الى زيادة الإنتاجية من السكر وتقليل الفجوة مابين الإنتاج والاستهلاك فى محاولة للوصول الى درجة الاكتفاء الذاتى ، ويعتمد هذا العمل على زيادة الإنتاجية من وحدة المساحة للمحاصيل السكرية بتحسين وسائل الإنتاج وخفض التكاليف وتتلخص الأهداف الرئيسية لقطاع البحوث الزراعية فيما يلى:-
1- تربية واستنباط أصناف جديدة لمحصول قصب السكر تتميز بارتفاع المحصول والسكر والمقاومة للأمراض والحشرات ومتلائمة مع الظروف البيئية الزراعية السائدة .
2- حصر ودراسة المشاكل المرضية فى المحاصيل السكرية وتحديد طرق علاجها .
3- تتبع نشاط الآفات الحشرية والحيوانية بالمحاصيل السكرية ووضع برامج متكاملة لمقاومتها مع التوسع فى أساليب المقاومة الحيوية .
4- تحسين المعاملات الزراعية من إعداد الأرض للزراعة وميعاد وطرق الزراعة ومزارع التقاوى والمقننات المائية والسمادية ومقاومة الحشائش والتكثيف الزراعى حتى الحصاد . كذلك التوسع فى توحيد الاعمار فى مناطق الإنتاج للحصول على أعلى جودة وإنتاجية .
5- دراسات فى تكنولوجيا المحاصيل السكرية من حيث النضج والتدهور وعلاقته بجودة التوريدات .
7- دراسة وإدخال تقنيات العمل الحديثة فى مجال البيوتكنولوجى من خلال إنشاء معامل زراعة الأنسجة .
8- استمرار وتنمية التعاون مع الجهات العلمية فى مجال المحاصيل السكرية محليا وعالميا.
9- تنمية الامكانيات المادية والموارد البشرية بالتدريب داخليا وخارجيا وإجراء الدراسات البحثية فى المجالات المختلفة لنيل درجات الماجستير والدكتوراة .
تقوم أربعة محطات بحوث زراعية والوحدات التابعة لها موزعة على مصانع الإنتاج بتنفيذ برامج العمل في المجالات المحددة بالأهداف ومواقع هذه المحطات والوحدات التابعة لها كما يلي:-